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Fakultative Parasiten sind Parasiten, die für ihre Vermehrung nicht auf den Wirt angewiesen sind und nur zeitweise dort gefunden werden. Sie können sich daher auch bei Fehlen eines geeigneten Wirtes entwickeln. Viele Saprophyten sind teilweise fakultative Parasiten, daher kommt es zu einer evolutionären Anpassung an den Wirt oder mehrere Wirte, wobei im Laufe der Zeit die Fähigkeit, ohne diesen auszukommen, verloren geht; dadurch wird ein Übergang geschaffen zum obligaten Parasitismus. Beispiele hierfür sind Maden verschiedener Fliegenarten, die sich an Lebewesen in Wunden ernähren können und so Myasis (="Madenfraß") auslösen.
